Органом громадського самоврядування ІІ медичного факультету є збори трудового колективу факультету.

Збори трудового колективу включають всі категорії працівників факультету, а також виборних представників з числа осіб, які навчаються на факультеті, за нормами представництва, які визначаються Вченою радою факультету. Учасників зборів, які є виборними представниками з числа студентів, обирають студенти факультету шляхом прямих таємних виборів. Учасників зборів, які є виборними представниками від аспірантів і докторантів, обирають збори аспірантів і докторантів факультету таємним голосуванням за нормами представництва, які визначає Вчена рада факультету.

Строк повноважень виборних представників від студентів, аспірантів і докторантів становить 3 роки. За 2 тижні до закінчення 3-річного строку повноважень цих представників проводиться обрання нових представників. Повноваження новообраних представників починають діяти з наступного дня після закінчення 3-річного строку повноважень попередніх представників. У разі дострокового припинення повноважень виборного представника обирається новий представник на строк до закінчення повноважень попереднього представника.

Для організації проведення виборів та контролю за виконанням норм представництва декан факультету створює робочу групу, до складу якої повинні входити всі категорії учасників освітнього процесу. Робоча група перевіряє правильність протоколів учасників зборів, готує список учасників зборів, проводить їх реєстрацію перед початком зборів та повідомляє про склад зборів і наявність кворуму.

Збори скликають за ініціативою декана факультету, Вченої ради факультету, Студентської ради факультету, виборного органу профспілкової організації працівників, виборного органу профспілкової організації студентів, аспірантів і докторантів, ініціативної групи, яка повинна зібрати не менше 1/4 підписів наукових і науково-педагогічних працівників факультету, для яких Університет є основним місцем роботи, або ректорату Університету.

Збори трудового колективу факультету скликають не рідше 1 разу на рік. Рішення зборів вважають правомочними, якщо на них були присутніми не менш як 2/3 їх складу. Збори відкритим голосуванням обирають президію та з числа її членів –головуючого. Регламент роботи затверджують самі збори. Рішення зборів вважають прийнятими, якщо за них проголосувало більше 50% присутніх учасників зборів.

Збори трудового колективу факультету:

1) заслуховують щорічний звіт декана факультету та дають оцінку його роботі;

2) затверджують річний звіт про діяльність факультету;

3) обирають виборних представників до Вченої ради факультету;

4) обирають делегатів на конференцію трудового колективу Університету;

5) обирають кандидатури до Вченої ради Університету;

6) надають згоду ректору на призначення декана факультету;

7) обговорюють кандидатури на посаду завідувача кафедри та за результатами обговорення таємним голосуванням більшістю голосів присутніх приймають висновки про професійні та особистісні якості претендентів та відповідні пропозиції;

8) вносять подання на звільнення декана факультету з підстав, визначених законодавством про працю, Статутом Університету, умовами контракту.